Нередко вагинит сочетается с эндоцервицитом, представляющим собой воспаление слизистой оболочки канала шейки матки. Вызывается эндоцервицит условно-патогенными микроорганизмами, теми же, что и вагинит. Важная роль в этиологии принадлежит хламидиям и гонококкам. Возникновению эндоцервицита способствуют разрывы шейки матки во время родов и абортов, заболевания половой системы (кольпит, эндометрит, аднексит, псевдоэрозия шейки матки и др.).